Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
EAARKRPGMYIGSTSERGLHHLVWEIVDNSIDEALAGYANQIEVVIEKDNWIKVTDNGRGIPVDIQEKMGRPAVEVILTV
GVGSSVVNALSQDLEVYVHRNETIYHQAYKKGVPQFDLKEVGTTDKTGTVIRFKADGEIFTETTVYNYETLQQRIRELAF
LNKGIQITLRDERDEENVREDSYHYEG

The query sequence (length=187) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4urm:B 195 194 1.0000 0.9590 0.9639 5.02e-135 5cph:A, 5cph:B, 5ctu:A, 5ctu:B, 5ctw:A, 5ctw:B, 5ctx:B, 5cty:B, 5d6p:A, 5d6p:B, 5d6q:B, 5d7c:A, 5d7c:B, 5d7d:A, 5d7d:B, 5d7r:A, 5d7r:B, 3g75:A, 3g75:B, 3g7b:A, 3g7b:B, 4p8o:A, 4p8o:B, 6tck:A, 6tck:B, 3ttz:A, 3ttz:B, 6ttg:A, 6ttg:B, 3u2d:A, 3u2d:B, 3u2k:A, 3u2k:B, 4urm:A, 4urm:C, 4urm:D, 4uro:A, 4uro:B, 4uro:C, 4uro:D, 5z9p:A, 5z9p:B
2 4gee:A 193 190 0.6203 0.6010 0.6105 1.20e-76 4gfn:A, 4ggl:A, 4hxw:A, 4k4o:A, 4ksg:A, 4ksh:A, 4ktn:A
3 6y8o:A 188 187 0.5455 0.5426 0.5455 3.47e-62 4b6c:A, 4b6c:B, 6y8o:B
4 7ptg:A 183 174 0.5134 0.5246 0.5517 1.04e-61
5 4hz5:A 191 191 0.5668 0.5550 0.5550 2.21e-61 4hz5:B, 4hz5:C, 4hz5:D, 4hz5:E, 4hz5:F, 4hz5:G, 4hz5:J
6 7ptf:A 212 207 0.5455 0.4811 0.4928 5.21e-61 8bn6:A, 6m1j:A, 6m1j:B, 6m1s:A, 6m1s:B, 7ptf:B, 7ptf:C, 7ptg:B
7 7pqi:A 198 199 0.5348 0.5051 0.5025 4.00e-60 7pql:A, 7pql:B, 7pqm:A, 7pqm:B
8 4url:A 364 192 0.5722 0.2940 0.5573 7.82e-60 4url:B, 4urn:A, 4urn:B, 4urn:C
9 6y8l:A 184 187 0.5187 0.5272 0.5187 3.20e-59 6y8l:B, 6y8n:A, 6y8n:B
10 3zm7:A 359 188 0.5294 0.2758 0.5266 3.78e-59 3zm7:B, 3zm7:C, 3zm7:D, 3zm7:E, 3zm7:F
11 9gbv:B 782 191 0.5508 0.1317 0.5393 8.18e-59 1aj6:A, 7c7n:A, 7c7o:A, 7dor:A, 7dor:B, 7dpr:A, 7dpr:B, 7dps:A, 7dps:B, 7dqf:A, 7dqf:B, 7dqh:A, 7dqh:B, 7dqi:A, 7dqi:B, 7dqj:A, 7dqj:B, 7dql:A, 7dql:B, 7dqm:A, 7dqm:B, 7dqs:A, 7dqs:B, 7dqu:A, 7dqu:B, 7dqw:A, 7dqw:B, 4duh:A, 4duh:B, 1ei1:A, 1ei1:B, 6eng:A, 6eng:B, 6f86:A, 6f8j:A, 6f94:A, 6f96:A, 3g7e:A, 9gbv:D, 9ggq:D, 9ggq:B, 4hyp:A, 4hyp:B, 4hyp:C, 4hyp:D, 6j90:A, 4kfg:A, 4kfg:B, 1kzn:A, 6kzv:A, 6kzx:A, 6kzz:A, 6l01:A, 5l3j:A, 5mmn:A, 5mmo:A, 5mmp:A, 7p2m:A, 7p2n:A, 7p2w:A, 7p2x:A, 4prv:A, 4prx:A, 4pu9:A, 8qdx:B, 8qdx:D, 8qqi:D, 8qqi:B, 8qqs:B, 8qqs:D, 8qqu:D, 6rku:D, 6rku:B, 6rkv:D, 6rkv:B, 6rkw:D, 6rkw:B, 4wub:A, 4wuc:A, 4wud:A, 4xtj:A, 6yd9:A, 5z4h:A, 5z4h:B, 5z4o:A, 5z4o:B, 5z9b:A, 5z9b:B, 5z9e:A, 5z9e:B, 5z9f:A, 5z9f:B, 5z9l:A, 5z9l:B, 5z9m:A, 5z9m:B, 5z9n:A, 5z9q:A, 5z9q:B, 7z9c:D, 7z9c:B, 7z9g:D, 7z9g:B, 7z9k:B, 7z9k:D, 7z9m:B, 7z9m:D, 4zvi:A, 5zxm:A, 5zxm:B
12 6zt3:A 394 206 0.5508 0.2614 0.5000 9.26e-58 4bae:A, 4bae:B, 4bae:C, 4bae:D
13 3zkb:D 392 211 0.5348 0.2551 0.4739 1.15e-56 3zkb:A, 3zkb:B, 3zkb:C, 3zkb:E, 3zkb:F, 3zkb:G, 3zkb:H, 3zkb:I, 3zkb:J, 3zkb:K, 3zkb:L, 3zkb:M, 3zkb:N, 3zkb:O, 3zkb:P, 3zkd:A, 3zkd:B, 3zkd:C, 3zkd:D, 3zkd:E, 3zkd:F, 3zkd:G, 3zkd:H
14 6gau:A 1088 173 0.5027 0.0864 0.5434 3.07e-53 5bs8:A, 5bs8:B, 5bs8:C, 5bs8:D, 5bta:A, 5bta:B, 5bta:C, 5bta:D, 5btc:A, 5btc:B, 5btc:C, 5btc:D, 5btd:A, 5btd:B, 5btd:C, 5btd:D, 5btf:A, 5btf:B, 5btf:C, 5btf:D, 5btg:A, 5btg:B, 5btg:C, 5btg:D, 5bti:A, 5bti:B, 5bti:C, 5bti:D, 5btl:A, 5btl:B, 5btl:C, 5btl:D, 5btn:A, 5btn:B, 5btn:C, 5btn:D, 9foy:A, 9foy:B, 6gau:B, 7ugw:A, 7ugw:B, 7ugw:C, 7ugw:D
15 5j5p:A 397 208 0.5134 0.2418 0.4615 9.06e-52 5boc:A, 5bod:A, 4em7:A, 4emv:A, 5j5p:B, 5j5q:B, 5j5q:A, 5j5q:C, 5j5q:D, 4lp0:A, 4lpb:A, 4mb9:A, 4mbc:A, 4mot:A, 5yig:A, 5yig:B
16 3fv5:B 181 174 0.4011 0.4144 0.4310 2.81e-39 3fv5:A, 1s14:A, 1s14:B
17 4i3h:A 1037 197 0.4706 0.0849 0.4467 3.98e-39 3foe:D, 3foe:C, 3fof:C, 3fof:D, 4i3h:B, 4juo:A, 4juo:C, 3k9f:A, 3k9f:C, 3k9f:D, 3k9f:B, 4koe:A, 4koe:C, 4koe:D, 4koe:B, 4kpe:A, 4kpe:C, 4kpe:D, 4kpe:B, 4kpf:A, 4kpf:C, 4kpf:D, 4kpf:B, 3ksa:A, 3ksa:C, 3ksa:D, 3ksa:B, 3ksb:A, 3ksb:B, 3ksb:C, 3ksb:D, 3ltn:A, 3ltn:C, 3ltn:D, 3ltn:B, 3rad:A, 3rad:C, 3rad:D, 3rad:B, 3rae:A, 3rae:C, 3rae:D, 3rae:B, 3raf:A, 3raf:C, 3raf:D, 3raf:B, 4z3o:B, 4z3o:A, 4z4q:A, 4z4q:B, 4z53:A, 4z53:B
18 1kij:A 384 194 0.4278 0.2083 0.4124 1.71e-37 6enh:A, 1kij:B
19 1s16:A 380 193 0.4118 0.2026 0.3990 9.90e-36 4hz0:A, 4hz0:B, 1s16:B
20 7cmp:A 374 207 0.4225 0.2112 0.3816 1.79e-35 7cmp:B, 7cmp:C, 7cmp:D, 3lps:A
21 4hxz:A 366 197 0.3904 0.1995 0.3706 2.89e-33 4hxz:B, 4hy1:A, 4hy1:B, 4hym:A, 4kqv:A, 4kqv:B
22 8yon:C 605 82 0.1925 0.0595 0.4390 2.80e-08 9imj:A, 8ylu:C, 8ylu:D, 8yo1:C, 8yo1:D, 8yo7:D, 8yo7:C, 8yod:C, 8yod:D, 8yon:D
23 7ebg:A 337 54 0.0856 0.0475 0.2963 0.008 2zdx:A
24 3d2r:B 362 59 0.0963 0.0497 0.3051 0.026 3d2r:A, 2e0a:A, 2e0a:B, 7eat:A, 7eat:B, 7ebb:A, 7ebb:B, 7ebg:B, 2zdx:B, 2zdy:A, 2zdy:B, 2zkj:A, 2zkj:B
25 8sbm:B 126 41 0.0909 0.1349 0.4146 0.078 8sbm:A, 3zxo:A, 3zxo:B
26 6eqo:A 1804 49 0.0856 0.0089 0.3265 0.29 6eqo:B
27 7l6s:A 396 85 0.1337 0.0631 0.2941 0.79
28 2q8g:A 368 53 0.0802 0.0408 0.2830 0.89 2q8h:A
29 6lzj:A 245 49 0.1070 0.0816 0.4082 0.91 6lzi:A
30 8g8e:X 140 44 0.0642 0.0857 0.2727 1.6 8g87:X, 8g88:X, 8g8b:X, 8g8g:X, 8sps:M, 7u0g:K
31 3l1p:A 147 51 0.0642 0.0816 0.2353 2.3 8bx2:A, 6ht5:E, 3l1p:B, 8sps:L, 8spu:L, 6t90:K, 7u0g:M, 7u0g:L, 7u0i:L, 7u0i:M
32 4r3a:B 278 45 0.0802 0.0540 0.3333 3.8
33 6n57:M 72 74 0.1070 0.2778 0.2703 4.1 6n58:M, 6psq:N, 6psr:N, 6pss:N, 6pst:N, 6psu:N, 6psv:N
34 5ix1:A 414 64 0.1123 0.0507 0.3281 4.6
35 3tz6:A 342 47 0.0749 0.0409 0.2979 8.2 3vos:A
36 5j71:A 338 59 0.0802 0.0444 0.2542 9.1
37 3crl:B 383 59 0.0749 0.0366 0.2373 9.4 2bu2:A, 2bu5:A, 2bu6:A, 2bu7:A, 2bu8:A, 3crk:A, 3crk:B, 3crl:A, 7ea0:A, 7eas:A, 7ebh:A, 5j6a:A, 1jm6:A, 1jm6:B, 6lil:A, 6lil:B, 6lin:A, 6lin:B, 6lin:C, 6lin:D, 6lio:A, 6lio:B, 5m4k:A, 5m4m:A, 5m4n:A, 5m4p:A, 4mp2:A, 4mp7:A, 4mpc:A, 4mpe:A, 4mpn:A, 6tmp:AAA, 6tmq:AAA, 6tmz:AAA, 6tn0:AAA, 6tn2:AAA, 4v25:A, 4v26:A, 7vbu:A, 7vbv:A, 7vbv:B, 7vbx:A, 8zm1:A, 8zm2:A
38 4r1f:A 366 61 0.1176 0.0601 0.3607 9.6 1zxn:A
39 6zy7:B 1160 61 0.1176 0.0190 0.3607 9.6 4fm9:A, 5gwk:A, 5gwk:B, 4r1f:B, 4r1f:C, 4r1f:D, 1zxm:A, 1zxm:B, 1zxn:B, 1zxn:C, 1zxn:D, 6zy5:B, 6zy5:A, 6zy6:A, 6zy6:B, 6zy7:A, 6zy8:A, 6zy8:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218