BioLiP

>protein
DLAAHIDHTLLKPTATLEEVAKAAEEALEYGFYGLCIPPSYVAWVRARYPHAPFRLVTVVGFPLGYQEKEVKALEAALAC
ARGADEVDMVLHLGRAKAGDLDYLEAEVRAVREAVPQAVLKVILETGYFSPEEIARLAEAAIRGGADFLKTSTGFGPRGA
SLEDVALLVRVAQGRAQVKAAGGIRDRETALRMLKAGASRLGTSSGVALV

The query sequence (length=210) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1ub3:A	211	210	1.0000	0.9953	1.0000	1.42e-149	1ub3:B, 1ub3:C, 1ub3:D
2	3ngj:D	222	209	0.4381	0.4144	0.4402	9.37e-57	3ngj:A, 3ngj:B, 3ngj:C
3	1jcj:A	252	171	0.2619	0.2183	0.3216	1.89e-13	5eky:A, 5el1:A, 5emu:A, 8for:A, 8for:B, 8for:C, 8for:D, 8for:E, 8for:F, 1jcj:B, 1jcl:A, 1jcl:B, 7p76:A, 7p76:B, 7p76:C, 7p76:D, 7p76:E, 7p76:F, 7p76:G, 7p76:H, 7p76:I, 7p76:J, 7p76:K, 7p76:L, 3q2d:A, 3q2d:B, 6z9i:B
4	3qyq:A	273	145	0.2238	0.1722	0.3241	1.25e-10	3qyq:B
5	1gth:A	1019	164	0.2143	0.0442	0.2744	0.014	8f5w:A, 8f5w:B, 8f5w:C, 8f5w:D, 8f61:A, 8f61:B, 8f61:C, 8f61:D, 8f6n:A, 8f6n:B, 8f6n:C, 8f6n:D, 1gt8:A, 1gt8:B, 1gt8:C, 1gt8:D, 1gte:A, 1gte:B, 1gte:C, 1gte:D, 1gth:B, 1gth:C, 1gth:D, 1h7w:A, 1h7w:B, 1h7w:C, 1h7w:D, 1h7x:A, 1h7x:B, 1h7x:C, 1h7x:D, 7ljs:A, 7ljs:B, 7ljs:C, 7ljs:D, 7ljt:A, 7ljt:B, 7ljt:C, 7ljt:D, 7lju:A, 7lju:C, 7lju:D, 7lju:B, 7m31:A, 7m31:B, 7m31:C, 7m31:D, 7m32:A, 7m32:B, 7m32:C, 7m32:D
6	1ep3:A	311	221	0.2619	0.1768	0.2489	0.43	1ep1:A, 1ep2:A, 5ksw:A, 5ksw:C, 5ue9:A, 5ue9:C
7	5dn1:A	240	87	0.1524	0.1333	0.3678	0.52
8	8gol:B	355	57	0.0905	0.0535	0.3333	0.66	8gol:A, 8gol:C, 8gol:D, 8goy:A, 8ive:A, 8ive:B, 8ivh:A, 8ivh:B, 8ivm:A, 8ivm:B, 8ivn:A, 8ivn:B, 8ivs:A, 8ivs:B, 8ivt:A, 8ivt:B, 8iw3:A, 8iw3:B, 8iw6:A, 8iw6:B, 8j7g:A, 8j7g:B, 8j7i:A, 8j7i:B, 8j7j:A, 8j7j:B, 8j7k:A, 8j7k:B, 8j7l:A, 8j7l:B, 7y0l:A, 7y0l:B, 7yd2:A, 7yd2:B
9	8b9z:D	430	44	0.0810	0.0395	0.3864	0.93	8esz:S2
10	7tn2:W	895	27	0.0619	0.0145	0.4815	1.2	9gd2:W, 9gd3:W
11	5w57:A	284	83	0.1381	0.1021	0.3494	2.0	5kzj:A, 5kzj:B, 5w56:A, 5w56:B, 5w57:B
12	6nke:A	249	24	0.0667	0.0562	0.5833	3.0
13	6ojd:A	227	51	0.0905	0.0837	0.3725	3.3	6ojd:B, 6ojd:C, 6ojd:D
14	7aor:aa	1558	31	0.0714	0.0096	0.4839	5.5
15	2fsn:B	311	97	0.1381	0.0932	0.2990	7.6	2fsn:A
16	3kdo:C	440	47	0.0810	0.0386	0.3617	8.2	3a12:A, 3a12:B, 3a12:C, 3a12:D, 3a12:E, 3a12:F, 3a12:G, 3a12:H, 3a12:I, 3a12:J, 3a13:A, 3a13:B, 3a13:C, 3a13:D, 3a13:E, 3a13:F, 3a13:G, 3a13:H, 3a13:I, 3a13:J, 3kdn:A, 3kdn:H, 3kdn:B, 3kdn:G, 3kdn:C, 3kdn:F, 3kdn:D, 3kdn:J, 3kdn:E, 3kdn:I, 3kdo:A, 3kdo:H, 3kdo:B, 3kdo:G, 3kdo:F, 3kdo:D, 3kdo:J, 3kdo:E, 3kdo:I, 3wqp:A, 3wqp:B, 3wqp:C, 3wqp:D, 3wqp:E, 3wqp:F, 3wqp:G, 3wqp:H, 3wqp:I, 3wqp:J
17	4jc0:A	424	85	0.1048	0.0519	0.2588	9.6	4jc0:B
18	8ity:B	1105	55	0.0667	0.0127	0.2545	9.7	7a6h:B, 7ae1:B, 7ae3:B, 7aea:B, 7d58:B, 7d59:B, 7fji:B, 7fjj:B, 8iue:B, 8iuh:B
19	5b48:B	286	56	0.0762	0.0559	0.2857	9.9

[Back]