BioLiP

>protein
AVDTGTEVVYRRPEARDGTRVWELIRDTGSLDLNSPYCYMLLGDYFNDTCMIAEHEGDIVGFISAFRSPRNPETLFVWQV
AVASSHRRQGIAKAMLTGLMNQKACHGVRFIETTVSPSNMASRRLFLGYAEEKSIPSTVTVGYGAEMFPDGTTHEDEPLF
VIGPFFNDIGSAWSH

The query sequence (length=175) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6sjy:B	175	175	1.0000	1.0000	1.0000	1.95e-132	6sjy:A, 6sjy:C, 6sk1:A, 6sl8:A, 6sll:A, 6sll:B
2	3d3s:A	159	156	0.3771	0.4151	0.4231	1.66e-35	3d3s:C, 3d3s:D, 3d3s:B
3	5hmn:B	159	75	0.1371	0.1509	0.3200	1.54e-05	5hmn:A, 5hmn:C, 5hmn:E, 5hmn:F
4	6bvc:A	154	76	0.1314	0.1494	0.3026	0.002	1bo4:A, 1bo4:B
5	5xxr:A	123	61	0.1143	0.1626	0.3279	0.10	5xxr:B, 5xxs:A, 5xxs:B
6	4jwp:A	165	78	0.1314	0.1394	0.2949	0.15
7	6c95:B	160	84	0.1486	0.1625	0.3095	0.18	6ppl:C, 6pw9:C
8	1nbh:A	292	36	0.0800	0.0479	0.3889	0.18	1d2h:A, 1d2h:B, 1d2h:C, 1d2h:D, 2idk:B, 2idk:C, 2idk:D, 2idk:A, 1kia:A, 1kia:B, 1kia:C, 1kia:D, 1nbh:B, 1nbh:C, 1nbh:D, 1nbi:A, 1nbi:B, 1nbi:C, 1nbi:D, 3thr:A, 3thr:B, 3thr:C, 3thr:D, 3ths:B, 3ths:C, 3ths:D, 3ths:A, 1xva:A, 1xva:B
9	4qb9:A	402	44	0.0971	0.0423	0.3864	0.28	4qb9:B, 4qb9:C, 4qb9:D, 4qb9:E, 4qb9:F, 3sxn:A, 3sxn:B, 3sxn:C, 3sxn:D, 3sxn:E, 3sxn:F
10	5k18:B	179	79	0.1371	0.1341	0.3038	0.36	5k04:B, 5k18:D
11	2cnm:A	151	91	0.1429	0.1656	0.2747	0.47	2cnm:B, 2cnm:C, 2cns:A, 2cns:B, 2cns:C, 2cnt:A, 2cnt:B, 2cnt:C, 2cnt:D
12	1s5k:A	153	64	0.0914	0.1046	0.2500	0.50	1s3z:A, 1s3z:B, 1s5k:B, 1s60:A, 2vbq:A, 2vbq:B
13	5jph:B	144	58	0.0971	0.1181	0.2931	0.76	5jph:A, 5jph:C
14	1x87:A	495	99	0.1600	0.0566	0.2828	1.1	1x87:B
15	4kq6:D	165	47	0.0857	0.0909	0.3191	1.5	4kq6:C, 4kq6:I, 4kq6:J
16	6wqc:A	293	82	0.1257	0.0751	0.2683	2.0	6wqb:A
17	6xru:A	309	35	0.0686	0.0388	0.3429	2.8	5cae:A, 1euc:A, 2fpg:A, 7msr:A, 7mss:A, 7mst:A, 6wcv:A, 4xx0:A
18	6gfm:A	440	72	0.1086	0.0432	0.2639	3.3
19	3ld2:B	162	58	0.0857	0.0926	0.2586	3.4	3ld2:A, 3ld2:C, 3ld2:D
20	7ovv:B	196	101	0.1314	0.1173	0.2277	3.5	7ovv:A
21	6th0:A	176	74	0.0971	0.0966	0.2297	5.1	6tgx:A, 6tgx:B, 6th0:B
22	8c7u:D	262	47	0.0743	0.0496	0.2766	6.8	8c7u:A, 8c7u:B, 8c7u:C
23	6b3t:A	396	28	0.0743	0.0328	0.4643	7.6	6b0u:A, 6b0u:B, 6b0u:C, 8d1r:A, 8d23:A, 8d25:A, 5ebv:A, 5ec4:A, 8f4a:A, 8f4t:A, 8f4u:A, 8f4w:A, 8f4z:A, 8f51:A, 8f55:A, 8f57:A, 8f58:A, 5iv0:A, 4jd6:A, 4jd6:B, 4jd6:C, 4jd6:D, 4jd6:E, 4jd6:F, 6p3t:A, 6p3u:A, 6p3v:A, 3r1k:A, 3ryo:A, 3ryo:B, 3ryo:C, 3ryo:D, 3ryo:E, 3ryo:F, 3ryo:G, 3ryo:H, 3ryo:I, 3ryo:J, 3ryo:K, 3ryo:L, 5tvj:A, 6vur:A, 6vus:A, 6vut:A, 6vuu:A, 6vuw:A, 6vux:A, 6vuy:A, 6vuz:A, 6vv0:A, 6vv1:A, 6vv2:A, 6vv3:A, 6x10:A, 6x6g:AAA, 6x6i:AAA, 6x6y:AAA, 6x7a:AAA
24	4jxr:B	185	76	0.1143	0.1081	0.2632	8.5
25	2obx:A	150	34	0.0571	0.0667	0.2941	8.9	2obx:E, 2obx:B, 2obx:C, 2obx:D, 2obx:F, 2obx:J, 2obx:G, 2obx:H, 2obx:I

[Back]