BioLiP

>protein
AQAPVSDRAWALFRALDGKGLVPDGYVEGWKKTFEEDFSPRRGAELVARAWTDPEFRQLLLTDGTAAVAQYGYLGPQGEY
IVAVEDTPTLKNVIVCSLCSCTAWPILGLPPTWYKSFEYRARVVREPRKVLSEMGTEIASDIEIRVYDTTAETRYMVLPQ
RPAGTEGWSQEQLQEIVTKDCLIGVAIPQVP

The query sequence (length=191) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1ahj:A	198	191	0.9948	0.9596	0.9948	1.79e-139	3a8g:A, 3a8h:A, 3a8l:A, 3a8m:A, 3a8o:A, 1ahj:C, 1ahj:E, 1ahj:G, 2ahj:A, 2ahj:C, 2cyz:A, 2cz0:A, 2cz1:A, 2cz6:A, 2cz7:A, 2d0q:A, 2qdy:A, 3wvd:A, 3wve:A, 3x20:A, 3x24:A, 3x25:A, 3x26:A, 3x28:A, 2zcf:A, 2zpb:A, 2zpe:A, 2zpf:A, 2zpg:A, 2zph:A, 2zpi:A
2	3qxe:A	201	193	0.5340	0.5075	0.5285	5.03e-68	3qxe:C, 3qxe:E, 3qxe:G, 3qyg:A, 3qyg:C, 3qyg:E, 3qyg:G, 3qyh:A, 3qyh:C, 3qyh:E, 3qyh:G, 3qz5:A, 3qz5:C, 3qz5:E, 3qz5:G, 3qz9:A, 3qz9:C, 3qz9:E, 3qz9:G
3	4fm4:A	206	186	0.4974	0.4612	0.5108	1.15e-63	4fm4:C, 4fm4:E, 4fm4:G, 4fm4:I, 4fm4:K, 4fm4:M, 4fm4:O, 4zgd:A, 4zgd:C, 4zgd:E, 4zgd:G, 4zgd:I, 4zgd:K, 4zgd:M, 4zgd:O, 4zge:A, 4zge:C, 4zge:E, 4zge:G, 4zge:I, 4zge:K, 4zge:M, 4zge:O, 4zgj:A, 4zgj:C, 4zgj:E, 4zgj:G, 4zgj:I, 4zgj:K, 4zgj:M, 4zgj:O
4	1v29:A	203	184	0.5131	0.4828	0.5326	7.29e-62	2dpp:A, 3hht:A, 7qom:A, 7qop:A, 7qou:A, 7qov:A, 7qoy:A, 7z0v:A
5	4ob3:A	204	185	0.4503	0.4216	0.4649	1.72e-59	9d6k:A, 8i6n:A, 1ire:A, 4ob0:A, 4ob1:A, 4ob2:A, 1ugp:A, 1ugr:A, 1ugs:A, 3vyh:A, 7w8l:A, 7w8m:A
6	2zzd:F	218	169	0.4136	0.3624	0.4675	1.31e-50	2dd5:C, 2dd5:F, 2dd5:I, 2dd5:L, 2dxb:C, 2dxb:F, 2dxb:I, 2dxb:L, 2dxb:O, 2dxb:R, 2dxb:U, 2dxb:X, 2dxc:C, 2dxc:F, 2dxc:I, 2dxc:L, 3vyg:C, 3vyg:F, 3vyg:I, 3vyg:L, 2zzd:C, 2zzd:I, 2zzd:L
7	7zaz:AAA	727	88	0.1414	0.0371	0.3068	0.19	7zaz:BBB, 7zaz:DDD, 7zb0:A, 7zb0:B, 7zb0:C, 7zb0:D, 7zb1:A, 7zb1:B, 7zb1:C, 7zb1:D, 7zb2:CCC, 7zb2:FFF
8	7zaz:CCC	690	88	0.1414	0.0391	0.3068	0.19
9	6eb3:B	268	39	0.0890	0.0634	0.4359	0.34	6eb3:A, 6eb3:C, 6eb3:D
10	6h42:A	393	59	0.1047	0.0509	0.3390	1.2	6h42:B, 6h45:A, 6h45:B, 7nq4:A, 8omr:A
11	6fb3:A	1836	64	0.1099	0.0114	0.3281	1.5	6fb3:B, 6fb3:C, 6fb3:D, 6ska:A, 6ske:A, 6ske:C
12	2bhz:A	589	48	0.0785	0.0255	0.3125	1.7	2bhy:A, 2bxy:A, 2bxz:A, 2by0:A, 2by1:A, 2by2:A, 2by3:A
13	6cb1:s	512	88	0.1257	0.0469	0.2727	2.5	6c0f:s
14	2nxx:E	234	24	0.0576	0.0470	0.4583	3.0	2nxx:F, 2nxx:G, 2nxx:H
15	1z5x:E	237	24	0.0524	0.0422	0.4167	3.5
16	3ndh:A	214	49	0.0785	0.0701	0.3061	3.8	3ndh:B
17	8iuf:V1	504	36	0.0681	0.0258	0.3611	4.2	8j9h:V1, 8j9i:V1, 8j9j:V1
18	7ohx:W	122	51	0.0838	0.1311	0.3137	4.2
19	6h62:A	370	59	0.0942	0.0486	0.3051	6.2	6h62:B
20	8qby:F	421	39	0.0628	0.0285	0.3077	6.4
21	7b2i:C	389	59	0.0942	0.0463	0.3051	6.5	7ov9:C, 7ovo:C, 7ovs:C, 7owz:C
22	3opy:B	884	25	0.0524	0.0113	0.4000	6.6	3opy:D, 3opy:F, 3opy:H
23	6s7o:A	656	38	0.0628	0.0183	0.3158	6.6	6ftg:5, 6fti:5, 6ftj:5, 8pn9:A
24	4ozt:E	238	24	0.0524	0.0420	0.4167	7.0
25	3ihj:A	461	25	0.0524	0.0217	0.4000	9.7

[Back]