APTAYTPLDVAQAYQFPEGLDGQGQCIAIIELGGGYDEASLAQYFASLGVPAPQVVSVSVDGASNQPTGDPSGPDGEVEL
DIEVAGALAPGAKFAVYFAPNTDAGFLDAITTAIHDPTLKPSVVSISWGGPEDSWTSAAIAAMNRAFLDAAALGVTVLAA
AGDSGSTDGEQDGLYHVDFPAASPYVLACGGTRLVASGGRIAQETVWNDGPDGGATGGGVSRIFPLPAWQEHANVPPSAN
PGASSGRGVPDLAGNADPATGYEVVIDGEATVIGGTSAVAPLFAALVARINQKLGKAVGYLNPTLYQLPADVFHDITEGN
NDIANRAQIYQAGPGWDPCTGLGSPIGVRLLQALL
The query sequence (length=355) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
| # | Hit | Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
E-value | Homologs to hit |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1t1e:A | 534 | 355 | 0.9239 | 0.6142 | 0.9239 | 0.0 | 1gt9:1, 1gt9:2, 1gtg:1, 1gtj:1, 1gtj:2, 1gtl:1, 1gtl:2, 4ne7:A, 1sio:A, 1sio:B, 1sio:C, 1siu:A, 1sn7:A, 1t1g:A, 1t1i:A, 1zvj:A, 1zvk:A, 1zvk:B |
| 2 | 3edy:A | 544 | 302 | 0.2901 | 0.1893 | 0.3411 | 1.03e-29 | 3ee6:A, 3ee6:B |
| 3 | 1ga1:A | 370 | 309 | 0.2704 | 0.2595 | 0.3107 | 5.20e-24 | 1ga4:A, 1ga6:A, 6m8w:A, 6m8y:A, 6m9c:A, 6m9d:A, 6m9f:A, 1nlu:A |
| 4 | 1bh6:A | 274 | 98 | 0.0873 | 0.1131 | 0.3163 | 0.14 | |
| 5 | 4a2c:A | 346 | 94 | 0.0789 | 0.0809 | 0.2979 | 0.67 | 4a2c:B, 4uej:A, 4uej:B, 4uek:A, 4uek:B, 4ueo:A, 4ueo:B |
| 6 | 5c3q:B | 311 | 100 | 0.0873 | 0.0997 | 0.3100 | 0.98 | 5c3o:A, 5c3p:D, 5c3q:C, 5c3r:B, 5c3r:C, 5c3s:B, 5c3s:C |
| 7 | 5c3q:A | 335 | 100 | 0.0873 | 0.0925 | 0.3100 | 1.0 | 5c3p:A, 5c3p:B, 5c3p:C, 5c3q:D, 5c3r:A, 5c3r:D, 5c3s:A, 5c3s:D |
| 8 | 4zi8:B | 323 | 37 | 0.0451 | 0.0495 | 0.4324 | 1.6 | 4zi8:A |
| 9 | 3gnq:C | 335 | 55 | 0.0507 | 0.0537 | 0.3273 | 3.5 | 3gnq:B, 3gnq:D, 3gnq:E, 3gnq:F, 3gnq:G, 3gnq:H |
| 10 | 4xo4:A | 870 | 56 | 0.0479 | 0.0195 | 0.3036 | 4.0 | 3b2p:A, 3b2x:A, 3b34:A, 3b37:A, 3b3b:A, 2dq6:A, 2dqm:A, 6g8b:A, 2hpo:A, 2hpt:A, 3ked:A, 5mfr:A, 5mfs:A, 5mft:A, 3puu:A, 4q4e:A, 4q4i:A, 3qjx:A, 4xmt:A, 4xmu:A, 4xmv:A, 4xmw:A, 4xmx:A, 4xmz:A, 4xn1:A, 4xn2:A, 4xn4:A, 4xn5:A, 4xn7:A, 4xn8:A, 4xn9:A, 4xna:A, 4xnb:A, 4xnd:A, 4xo3:A, 4xo5:A, 5yo1:A, 5yq1:A, 5yq2:A, 5yqb:A, 2zxg:A |
| 11 | 2jfn:A | 266 | 34 | 0.0366 | 0.0489 | 0.3824 | 7.7 | |
| 12 | 3whi:A | 355 | 68 | 0.0620 | 0.0620 | 0.3235 | 8.3 | 4dww:A, 5gl8:B, 1mee:A, 6o44:A, 6o44:B, 6pak:A, 6pak:B, 1scj:A, 3vyv:A, 3vyv:B, 3whi:B |
| 13 | 8bf6:A | 278 | 47 | 0.0451 | 0.0576 | 0.3404 | 9.1 | 8bj9:A |
| 14 | 8c4z:B | 282 | 45 | 0.0479 | 0.0603 | 0.3778 | 9.3 | |
| 15 | 4lls:A | 300 | 63 | 0.0620 | 0.0733 | 0.3492 | 9.3 | 4lls:B, 4llt:A, 4llt:B |
umich.edu