BioLiP

>protein
AMSYSLYGTTLEQQYNKPLSDLLIRCINCQKPLSPEEKQRHLDKKQRFHNIRGRWTGRCMSCSRSSR

The query sequence (length=67) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7uaj:B	512	64	0.9552	0.1250	1.0000	7.27e-44	2fk4:A, 8gcr:A, 4giz:C, 4giz:D, 8jrn:D, 8jrn:B, 8jro:D, 8jro:B, 8jrp:B, 8jrp:D, 8jrq:B, 8jrq:D, 8jrr:B, 8jrr:D, 8r1f:B, 8r1g:B, 8r1g:E, 6siv:B, 6sja:B, 7uaj:A, 7uaj:C, 7uaj:D, 4xr8:F
2	4xr8:H	151	65	0.9701	0.4305	1.0000	1.10e-43	2ljx:A, 2ljy:A, 2ljy:B, 2ljz:A
3	6slm:A	539	64	0.7313	0.0909	0.7656	7.60e-33
4	2m3l:A	76	66	0.5821	0.5132	0.5909	1.88e-23
5	6sjv:A	529	60	0.5373	0.0681	0.6000	7.03e-21	6sqc:A
6	6smv:A	525	59	0.2687	0.0343	0.3051	4.94e-06
7	3py7:A	500	58	0.3134	0.0420	0.3621	2.92e-04
8	3a7h:B	291	30	0.1642	0.0378	0.3667	0.29	3a7h:A, 3a7i:A, 3a7j:A, 7b30:A, 7b31:A, 7b32:A, 7b33:A, 7b34:A, 7b35:A, 7b35:B, 8bzi:A, 8bzj:A, 8bzj:B, 3ckx:A, 4o27:B, 8qlq:A, 8qlr:B, 8qlr:A, 8qls:A, 8qlt:A, 4qml:A, 4qmm:A, 4qmn:A, 4qmo:A, 4qmp:A, 4qmq:A, 4qms:A, 4qmt:A, 4qmu:A, 4qmv:A, 4qmw:A, 4qmx:A, 4qmy:A, 4qmz:A, 4qna:A, 4qo9:A, 4qo9:B, 4u8z:A, 4w8d:A, 4w8e:A
9	4jz7:A	285	31	0.1940	0.0456	0.4194	0.52	4jz7:B
10	4jz7:C	316	31	0.1940	0.0411	0.4194	0.52	4jz7:D, 4jz8:A, 4jz8:B, 4jz8:C, 4jz8:D, 4jz9:A, 4jz9:B, 4jz9:C, 4jz9:D, 4olc:A, 4olc:C
11	3uh1:A	367	30	0.1493	0.0272	0.3333	1.1	2qrj:A, 2qrk:A, 3uha:A, 3uha:B
12	1e7d:A	157	35	0.1642	0.0701	0.3143	1.8	1e7d:B, 1e7l:A, 1e7l:B, 1en7:A, 1en7:B, 2qnc:A, 2qnc:B, 2qnf:A, 2qnf:B
13	2das:A	62	24	0.1791	0.1935	0.5000	2.0
14	2cup:A	101	39	0.1791	0.1188	0.3077	2.5
15	2xik:A	289	30	0.1493	0.0346	0.3333	2.7	4nzw:B, 7z4v:A
16	2dcu:A	407	29	0.1642	0.0270	0.3793	3.5	2d74:A, 1kjz:A, 1kk0:A, 1kk1:A, 1kk2:A, 1kk3:A
17	4hb9:A	376	32	0.1642	0.0293	0.3438	5.1
18	1dwk:B	156	41	0.1940	0.0833	0.3171	5.4	1dwk:D, 1dwk:C, 1dwk:I, 1dwk:E, 1dwk:F, 1dwk:G, 1dwk:H, 1dwk:A, 1dwk:J, 2iu7:A, 2iu7:J, 2iu7:C, 2iu7:I, 2iu7:B, 2iu7:D, 2iu7:E, 2iu7:F, 2iu7:G, 2iu7:H, 2iuo:B, 2iuo:C, 2iuo:D, 2iuo:G, 2iuo:H, 2iuo:I, 2iv1:G, 2iv1:I, 2ivb:C, 2ivb:A, 2ivb:G, 2ivb:F, 2ivb:D, 2ivb:H, 2ivb:I, 2ivq:H, 2ivq:J, 8k6h:A, 8k6h:B, 8k6h:C, 8k6h:D, 8k6h:E, 8k6h:F, 8k6h:G, 8k6h:H, 8k6h:I, 8k6h:J, 8k6s:A, 8k6s:B, 8k6s:I, 8k6s:G, 8k6s:F, 8k6x:A, 8k6x:B, 8k6x:H, 8k6x:C, 8k6x:D, 8k6x:E, 8k6x:G, 8k6x:F, 8k6x:I, 8k6x:J
19	1rqg:A	606	42	0.2090	0.0231	0.3333	5.4
20	6ulw:A	1193	39	0.1940	0.0109	0.3333	5.5	6ulw:D, 6ulx:A, 6uly:A, 6uly:B
21	3qum:Q	237	28	0.1791	0.0506	0.4286	6.5	2zck:P
22	1s49:A	588	37	0.1791	0.0204	0.3243	8.5
23	4kjz:C	458	45	0.1493	0.0218	0.2222	8.8	4b43:A, 4b44:A, 4b47:A, 4b48:A, 4kjz:A
24	5b68:A	703	29	0.1642	0.0156	0.3793	9.7

[Back]