BioLiP

>protein
ALEGLRKKYKTRQELVKALTPKRRSIHLNSCSNADVLAHIKHFLSLAANSLEQHQQPISIVFQNKKKHTTLDFPLNGPHL
STHQFKLKRCAILLNLLKVVMEKLPLGKNTTVRDIFYSNVELFQRQANVVQWLDVIRFNFKLSPRKSLNIIPAQKGLVYS
PFPIDIYDNIQKQTIFSGKPCLIPFFQDDAVIKLGNIVIVEKEAVFTKLVNNYHNTMLITGKGFPDFLTRLFLKKLEQYC
SNLISDCSIFTDADPYGISIALNYTHSNERNAYICTMANYKGIRITQVLAQNNESIQLLSLNQRDYSLAKNLIASLTANS
WDIATSPLKNVVIECQREIFFQKKAEMNEIDAGIFKYK

The query sequence (length=358) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8uru:A	363	364	0.9972	0.9835	0.9808	0.0	8urq:A
2	1d3y:B	290	66	0.0642	0.0793	0.3485	0.003	1d3y:A
3	8wkj:A	391	70	0.0670	0.0614	0.3429	0.030
4	1lr5:D	160	78	0.0670	0.1500	0.3077	0.11	1lr5:C, 1lr5:B, 1lr5:A, 1lrh:D, 1lrh:C, 1lrh:B, 1lrh:A
5	8g1e:A	1037	158	0.1117	0.0386	0.2532	0.50	8g1e:B, 8g1e:D, 8g1e:C, 8g1f:A, 8g1f:C, 8g1f:B, 8g1f:D, 8g5c:A, 8g5c:B, 8g5c:C, 8g5c:D, 8g5d:A, 8g5d:B, 8g5d:C, 8g5d:D, 6hxh:A, 6hxh:B, 6hxh:C, 6hxh:D, 6hxh:E, 6hxh:F, 6hxh:G, 6hxh:H, 6hxk:A, 6hxk:B, 6hxk:C, 6hxk:D, 6hxl:A, 6hxl:B, 6hxl:C, 6hxl:D, 6hxl:E, 6hxl:F, 6hxl:G, 6hxl:H, 6hxm:A, 6hxm:B, 7liw:B, 7liw:D, 7lj9:A, 7lj9:B, 7lj9:C, 7lj9:D, 7lla:A, 7lla:C, 7lla:B, 7lla:D, 3mwe:A, 6o0h:A, 6o0h:B, 6o0h:C, 6o0h:D, 3pff:A, 6poe:B, 6poe:D, 6poe:A, 6poe:C, 6qfb:A, 6qfb:B, 6qfb:D, 7rig:A, 7rig:C, 7rig:B, 7rig:D, 7rkz:A, 7rkz:C, 7rkz:B, 7rkz:D, 7rmp:A, 7rmp:C, 7rmp:B, 7rmp:D, 5tde:A, 5tde:B, 5tdf:A, 5tdm:A, 5tdm:B, 5tdz:A, 5te1:A, 5te1:B, 5teq:A, 5teq:B, 5tes:A, 5tet:A, 6ui9:A, 6ui9:C, 6ui9:B, 6ui9:D, 6uia:C, 6uia:A, 6uia:D, 6uia:B, 6uuw:A, 6uuw:C, 6uuw:B, 6uuw:D, 6uuz:A, 6uuz:C, 6uuz:B, 6uuz:D, 6uv5:A, 6uv5:C, 6uv5:B, 6uv5:D, 6z2h:A, 6z2h:C, 6z2h:D
6	6y9c:A	365	94	0.0754	0.0740	0.2872	0.55	6y8s:A, 6y9d:A, 6y9d:B, 6y9d:C, 6y9d:D, 6y9d:E, 6y9d:F, 6y9d:G, 6y9d:H, 6y9d:I, 6y9d:J, 6y9d:K, 6y9d:L, 6zgp:A, 6zgp:B, 6zgp:C, 6zgp:D, 6zgp:E, 6zgp:F, 6zgp:G, 6zgp:H, 6zgp:I, 6zgp:J, 6zgp:K, 6zgp:L
7	6qfb:C	1011	154	0.1061	0.0376	0.2468	0.84
8	1f3r:B	257	63	0.0503	0.0700	0.2857	0.88
9	6y8j:A	343	113	0.0810	0.0845	0.2566	0.96
10	8sny:A	1388	33	0.0447	0.0115	0.4848	1.3	8fu3:A, 8snx:A
11	1iri:A	557	140	0.0922	0.0592	0.2357	4.3	1dqr:A, 1dqr:B, 1g98:A, 1g98:B, 1gzv:A, 1hox:A, 1hox:B, 1iri:B, 1iri:C, 1iri:D, 1koj:A, 1koj:B, 1nuh:A, 1xtb:A, 1xtb:B, 6xuh:A, 6xuh:B, 6xuh:C, 6xuh:D, 6xui:A, 6xui:B, 6xui:C, 6xui:D
12	5hji:A	349	164	0.0950	0.0974	0.2073	4.8	5hjk:A, 5hjm:A, 5wt1:A, 5wt1:B, 5wt3:A
13	4mvf:A	408	76	0.0698	0.0613	0.3289	5.2	3pm8:A, 3pm8:B
14	3ec7:A	336	53	0.0363	0.0387	0.2453	8.1	3ec7:B, 3ec7:C, 3ec7:D, 3ec7:E, 3ec7:F, 3ec7:G, 3ec7:H
15	1h0h:A	977	26	0.0363	0.0133	0.5000	9.8	1h0h:K

[Back]