BioLiP

>protein
AEIKNVILMIGDGMGPQQVGLLETYANQAPNSIYKGNKTAIYQLAQEGVIGSSLTHPEDAIVVDSACSATMLATGIYSSS
EVIGIDSQGNHVETVLEKAKKAGKATGLVSDTRLTHATPASFAAHQPHRSLENQIASDMLATGADVMLSGGLRHWIPKST
NDKGETYKQLEKLTQGDVYLKSKRKDDRNLLTEAEKDGYQLAFNRNMLDDAKGDKLLGLFAYSGMDDGIAYSNKKKSGER
TQPSLKEMTQKALNILSKDEDGFFLMVEGGQIDWAGHSNDAGTMLHELLKFDEAIQTVYEWAKDREDTIVIVTADHETGS
FGFSYSSNDLPKPQKRSGEAFADRDYAPNFNFGAFDILDGLYNQKQSYYGMISEFQKLDKSLQTPEKLAEIVNKNSEFPI
TAEQAKNVLASKPNPYRLAQHKYLSAEEVPAINDFDAFFPYNDRGNLLAREQATGQNIVWGTGTHTHTPVNVFAWGPAEK
ILPVSKIMHHSELGEYIKQQVNFEK

The query sequence (length=505) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7qow:B	505	505	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3e2d:A, 3e2d:B, 7qow:A, 7qp8:A, 7qp8:B, 6qsq:A, 6t26:A, 6t26:B, 7yzz:A, 7yzz:B, 7z00:B
2	3wbh:A	497	500	0.6891	0.7002	0.6960	0.0	3wbh:B
3	2w5v:A	346	355	0.2277	0.3324	0.3239	9.64e-42	2iuc:A, 2iuc:B, 2w5v:B, 2w5w:A, 2w5w:B, 2w5x:A, 2w5x:B
4	3a52:A	400	360	0.2297	0.2900	0.3222	1.20e-37	3a52:B
5	7kwd:A	473	345	0.2099	0.2241	0.3072	1.73e-36	7kwd:B
6	4kjg:A	486	344	0.2218	0.2305	0.3256	3.75e-35	4kjd:A, 4kjd:B, 4kjg:B
7	1ajb:A	449	356	0.2376	0.2673	0.3371	9.51e-35	1ajb:B, 1ajc:A, 1ajc:B, 1ajd:A, 1ajd:B, 1alh:A, 1alh:B, 1ali:A, 1ali:B, 1alj:A, 1alj:B, 1alk:A, 1alk:B, 1ani:A, 1ani:B, 1anj:A, 1anj:B, 2anh:A, 2anh:B, 1b8j:A, 1b8j:B, 3bdh:A, 3bdh:B, 5c66:A, 5c66:B, 3cmr:A, 3cmr:B, 3dpc:B, 3dpc:A, 3dyc:A, 3dyc:B, 1ed8:A, 1ed8:B, 1ed9:A, 1ed9:B, 1elx:A, 1elx:B, 1ely:A, 1ely:B, 1elz:A, 1elz:B, 1ew8:A, 1ew8:B, 1ew9:A, 1ew9:B, 2g9y:A, 2g9y:B, 2ga3:A, 2ga3:B, 1hjk:A, 1hjk:B, 1hqa:A, 1hqa:B, 1kh4:A, 1kh4:B, 1kh5:A, 1kh5:B, 1kh7:A, 1kh7:B, 1kh9:A, 1kh9:B, 1khj:A, 1khj:B, 1khk:A, 1khk:B, 1khl:A, 1khl:B, 1khn:A, 1khn:B, 4km4:A, 4km4:B, 3tg0:A, 3tg0:B, 3tg0:C, 3tg0:D, 5tpq:A, 5tpq:B, 1ura:A, 1ura:B, 1urb:A, 1urb:B, 1y6v:A, 1y6v:B, 1y7a:A, 1y7a:B, 4yr1:A, 4yr1:B
8	1k7h:A	476	360	0.2257	0.2395	0.3167	1.72e-33	1k7h:B, 1shn:A, 1shn:B, 1shq:A, 1shq:B
9	3mk0:A	481	354	0.2238	0.2349	0.3192	3.21e-33	1ew2:A, 2glq:A, 3mk1:A, 3mk2:A, 1zeb:A, 1zed:A, 1zef:A
10	7yiv:A	484	347	0.2198	0.2293	0.3199	3.33e-33	7yiv:D, 7yiv:C, 7yiv:B, 7yiv:G, 7yiv:H, 7yiv:F, 7yiv:E, 7yiw:A, 7yiw:D, 7yiw:C, 7yiw:B, 7yiw:G, 7yiw:H, 7yiw:F, 7yiw:E, 7yix:A, 7yix:B
11	7tm9:A	441	378	0.2337	0.2676	0.3122	1.00e-32	7tm9:B, 7tm9:C, 7tm9:D, 7tm9:E, 7tm9:F, 7tm9:G, 7tm9:H
12	2x98:A	430	251	0.1624	0.1907	0.3267	1.83e-24	2x98:B
13	5zeb:e	198	66	0.0416	0.1061	0.3182	0.30	6dzi:m, 6dzk:E, 8fr8:f, 7kgb:e, 7msc:e, 7msh:e, 7msm:e, 7msz:e, 7mt2:e, 7mt3:e, 7mt7:e, 5o5j:E, 5o61:BE, 7sfr:e, 5v93:e, 8v9j:e, 8v9k:e, 8v9l:e, 8whx:f, 8wi7:f, 8wi9:f, 8wib:f, 8wid:f, 8wif:f, 5xyu:E, 5zep:e, 5zeu:e
14	2vss:B	247	247	0.1089	0.2227	0.2227	1.4	6l3p:A, 6l3p:B, 2vss:D, 2vss:E, 2vss:F, 2vsu:A, 2vsu:B, 2vsu:D, 2vsu:E, 2vsu:F
15	8qjz:A	239	83	0.0436	0.0921	0.2651	1.7	8qk9:A, 8s7f:A
16	2zkt:B	381	83	0.0455	0.0604	0.2771	1.7
17	7t8t:A	1086	105	0.0594	0.0276	0.2857	1.8
18	5z2g:A	477	57	0.0356	0.0377	0.3158	2.5	5z2g:B
19	2zkt:A	330	102	0.0515	0.0788	0.2549	2.7
20	3mvd:L	394	66	0.0297	0.0381	0.2273	6.6	3mvd:K
21	8crx:E	179	66	0.0356	0.1006	0.2727	6.9	8cvo:E, 8cwo:E
22	4ynt:A	570	27	0.0218	0.0193	0.4074	7.1	7vkd:A, 7vkf:A, 7vzp:A, 7vzp:B, 7vzs:A, 7vzs:B, 4ynu:A
23	1kwf:A	363	75	0.0436	0.0606	0.2933	8.3

[Back]