BioLiP

>protein
AATQTWTGDLAIVTIPFSSLRFVKVTPPFSYKKRRAVIETHYDQATKVLLEFSRRWWEFTEADWKRELDAIAPGLYDYYQ
QWGEDDAEAA

The query sequence (length=90) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7e0d:A	604	90	1.0000	0.1490	1.0000	1.44e-58	7e0c:A, 2e1m:A, 2e1m:B, 2e1m:C, 8jpw:A
2	1f8r:A	483	56	0.2111	0.0393	0.3393	1.01e-05	1f8r:B, 1f8r:C, 1f8r:D, 1f8s:A, 1f8s:B, 1f8s:C, 1f8s:D, 1f8s:E, 1f8s:F, 1f8s:G, 1f8s:H, 2iid:A, 2iid:B, 2iid:C, 2iid:D
3	3kve:A	484	56	0.2111	0.0393	0.3393	2.94e-05	3kve:B, 3kve:C, 3kve:D
4	5ts5:A	483	56	0.2111	0.0393	0.3393	3.68e-05	4e0v:A, 4e0v:B, 5ts5:B, 5ts5:C, 5ts5:D
5	1reo:A	484	54	0.2000	0.0372	0.3333	7.52e-05	1tdk:A, 1tdn:A, 1tdo:A
6	5z2g:A	477	52	0.2111	0.0398	0.3654	2.98e-04	5z2g:B
7	3ng7:X	427	69	0.2333	0.0492	0.3043	0.001	3k7m:X, 3k7q:X, 3k7t:A, 3k7t:B, 3ngc:X, 3nh3:X, 3nho:X, 3nk0:X, 3nk1:X, 3nk2:X, 3nn0:X, 3nn6:X
8	5mbx:A	472	50	0.1889	0.0360	0.3400	0.030	5lae:A, 5lfo:A, 5lgb:A
9	7xe1:A	751	55	0.1667	0.0200	0.2727	0.039	4fwe:A, 4fwf:A, 4fwj:A, 4fwj:B, 4gu0:A, 4gu0:C, 4gu0:B, 4gu0:D, 4gu1:A, 4gu1:B, 4gur:A, 4gus:A, 4gut:A, 4guu:A, 4hsu:A, 6r1u:K, 6r25:K, 7xe1:B, 7xe2:A, 7xe2:B, 7xe3:A, 7xe3:B
10	7kho:D	405	47	0.1222	0.0272	0.2340	0.085
11	6c71:B	440	78	0.1889	0.0386	0.2179	0.11	7c49:A, 7c49:B, 7c4a:A, 7c4a:B, 6c71:A, 6c71:C, 6c71:D, 8dq7:A, 8dq7:B, 8dq8:A, 8dq8:B, 8dsv:A, 8dsv:B, 7khn:A, 7kho:A, 7kho:B, 7kho:C, 5ttj:A, 5ttj:B, 5ttk:A, 5ttk:B, 5ttk:C, 5ttk:D
12	7d4c:A	595	22	0.1333	0.0202	0.5455	0.25	7c3h:A, 7c3h:B, 7c3i:A, 7c3i:B, 7c3j:A, 7c3j:B, 7c3l:A, 7c3l:B, 7d4d:A, 7d4e:A, 3x0v:A, 3x0v:B
13	4bay:A	670	57	0.1778	0.0239	0.2807	0.61	3abt:A, 3abu:A, 8bop:A, 8box:A, 7cdc:A, 7cdd:A, 7cde:A, 7cdf:A, 7cdg:A, 4czz:A, 7e0g:A, 2ejr:A, 8f2z:A, 8f30:A, 8f59:A, 8f6s:A, 8fdv:A, 8fj4:A, 8fj6:A, 8fj7:A, 8fqj:A, 8fri:A, 8frq:A, 8frv:A, 8fsk:A, 9fwg:A, 5h6q:A, 5h6r:A, 2h94:A, 2hko:A, 8inl:A, 2iw5:A, 8jf5:A, 6k3e:A, 6kgk:A, 6kgl:A, 6kgm:A, 6kgn:A, 6kgo:A, 6kgp:A, 6kgq:A, 6kgr:A, 4kum:A, 5l3b:A, 5l3c:A, 5l3d:A, 5l3e:A, 5l3f:A, 5l3g:A, 5lbq:A, 5lgn:A, 5lgt:A, 5lgu:A, 5lhg:A, 5lhh:A, 5lhi:A, 6nqm:A, 6nqu:A, 6nr5:A, 8q1g:A, 8q1h:A, 8q1j:A, 6s35:A, 6te1:A, 6tuy:A, 4uv8:A, 4uv9:A, 4uva:A, 4uvb:A, 4uvc:A, 2uxn:A, 2uxx:A, 4uxn:A, 2v1d:A, 7vqs:A, 7vqt:A, 7vqu:A, 6vyp:k, 6vyp:m, 6vyp:M, 6vyp:K, 7w3l:A, 6w4k:A, 6wc6:A, 2x0l:A, 5x60:A, 2xaf:A, 2xag:A, 2xah:A, 2xaj:A, 2xaq:A, 2xas:A, 4xbf:A, 7xw8:A, 2y48:A, 5yjb:A, 8ym7:A, 2z3y:A, 2z5u:A, 3zms:A, 3zmt:A, 3zmu:A, 3zmv:A, 3zmz:A, 3zn0:A, 3zn1:A, 7zry:A
14	2dw4:A	634	57	0.1778	0.0252	0.2807	0.65
15	2jae:A	478	58	0.1889	0.0356	0.2931	0.85	2jae:B, 2jb1:A, 2jb1:B, 2jb2:A, 2jb2:B, 2jb3:A, 2jb3:B
16	1oj7:A	390	35	0.1111	0.0256	0.2857	1.4	1oj7:B, 1oj7:C, 1oj7:D, 4qgs:A
17	4ilv:B	157	28	0.1333	0.0764	0.4286	1.6	4ilt:A, 4ilt:B, 4ilt:C, 4ilt:D, 4ilv:A
18	6gu2:A	294	31	0.1556	0.0476	0.4516	1.8	6gu3:A, 6gu4:A, 6gu6:A, 6gu7:A, 5hq0:A, 5lqf:A, 5lqf:D, 4y72:A
19	1obg:A	305	45	0.1444	0.0426	0.2889	1.8	2cnq:A, 2cnu:A, 2cnv:A, 1obd:A
20	6m9t:A	444	56	0.1778	0.0360	0.2857	1.9
21	1jvz:A	152	40	0.1444	0.0855	0.3250	2.8
22	8gyw:B	380	51	0.1889	0.0447	0.3333	5.3	8gyw:A, 8gyx:B, 8gyx:A
23	7asd:AA	413	32	0.1333	0.0291	0.3750	7.5	7asd:BA, 7asd:CA, 7asd:DA, 7asd:EA, 7asd:FA, 7asd:GA, 7asd:HA, 5yyl:A
24	6ff7:9	432	60	0.1667	0.0347	0.2500	7.9
25	5yyl:B	375	32	0.1333	0.0320	0.3750	8.5

[Back]