Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 197122 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.

    • Sort results by
    << < 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)     		Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    140401 6uwi:b (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140402 6uwi:b (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140403 6uwi:b (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140404 6uwi:b (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140405 6uwi:b (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140406 6uwi:c (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140407 6uwi:c (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140408 6uwi:c (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140409 6uwi:c (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140410 6uwi:c (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140411 6uwi:c (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140412 6uwi:d (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140413 6uwi:d (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140414 6uwi:d (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140415 6uwi:d (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140416 6uwi:d (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140417 6uwi:d (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140418 6uwi:e (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140419 6uwi:e (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140420 6uwi:e (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140421 6uwi:e (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140422 6uwi:e (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140423 6uwi:e (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140424 6uwi:f (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140425 6uwi:f (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140426 6uwi:f (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140427 6uwi:f (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140428 6uwi:f (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140429 6uwi:f (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140430 6uwi:g (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140431 6uwi:g (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140432 6uwi:g (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140433 6uwi:g (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140434 6uwi:g (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140435 6uwi:g (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140436 6uwi:h (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140437 6uwi:h (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140438 6uwi:h (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140439 6uwi:h (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140440 6uwi:h (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140441 6uwi:h (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140442 6uwi:i (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140443 6uwi:i (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140444 6uwi:i (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140445 6uwi:i (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140446 6uwi:i (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140447 6uwi:i (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140448 6uwi:j (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140449 6uwi:j (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140450 6uwi:j (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140451 6uwi:j (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140452 6uwi:j (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140453 6uwi:j (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140454 6uwi:k (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140455 6uwi:k (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140456 6uwi:k (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140457 6uwi:k (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140458 6uwi:k (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140459 6uwi:k (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140460 6uwi:l (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140461 6uwi:l (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140462 6uwi:l (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140463 6uwi:l (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140464 6uwi:l (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140465 6uwi:l (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140466 6uwi:m (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140467 6uwi:m (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140468 6uwi:m (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140469 6uwi:m (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140470 6uwi:m (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140471 6uwi:m (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140472 6uwi:n (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140473 6uwi:n (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140474 6uwi:n (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140475 6uwi:n (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140476 6uwi:n (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140477 6uwi:n (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140478 6uwj:A (1.852) BS03 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    140479 6uwj:A (1.852) BS04 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    140480 6uwj:A (1.852) BS05 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    140481 6uwk:A (2.533) BS03 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    140482 6uwk:A (2.533) BS04 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    140483 6uwk:A (2.533) BS05 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    140484 6uwk:A (2.533) BS06 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    140485 6uwk:A (2.533) BS07 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    140486 6uwn:A (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140487 6uwn:A (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140488 6uwn:A (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140489 6uwn:B (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140490 6uwn:B (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140491 6uwn:B (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140492 6uwn:C (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140493 6uwn:C (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140494 6uwn:C (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140495 6uwn:D (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140496 6uwn:D (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140497 6uwn:D (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140498 6uwn:E (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140499 6uwn:E (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140500 6uwn:E (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140501 6uwn:F (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140502 6uwn:F (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140503 6uwn:G (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140504 6uwn:G (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140505 6uwn:G (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140506 6uwn:H (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140507 6uwn:H (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140508 6uwr:A (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140509 6uwr:A (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140510 6uwr:A (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140511 6uwr:B (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140512 6uwr:B (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140513 6uwr:B (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140514 6uwr:C (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140515 6uwr:C (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140516 6uwr:C (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140517 6uwr:D (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140518 6uwr:D (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140519 6uwr:D (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140520 6uwr:E (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140521 6uwr:E (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140522 6uwr:E (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140523 6uwr:F (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140524 6uwr:F (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140525 6uwr:F (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140526 6uwr:G (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140527 6uwr:G (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140528 6uwr:G (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140529 6uwr:H (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140530 6uwr:H (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140531 6uwr:H (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140532 6uwr:I (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140533 6uwr:I (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140534 6uwr:I (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140535 6uwr:J (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140536 6uwr:J (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140537 6uwr:J (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140538 6uwr:K (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140539 6uwr:K (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140540 6uwr:K (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140541 6uwr:L (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140542 6uwr:L (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140543 6uwr:L (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140544 6uwr:M (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140545 6uwr:M (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140546 6uwr:M (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140547 6uwr:N (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140548 6uwr:N (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140549 6uwr:N (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140550 6uwt:A (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140551 6uwt:A (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140552 6uwt:B (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140553 6uwt:B (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140554 6uwt:C (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140555 6uwt:C (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140556 6uwt:D (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140557 6uwt:D (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140558 6uwt:E (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140559 6uwt:E (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140560 6uwt:F (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140561 6uwt:F (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140562 6uwt:G (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140563 6uwt:G (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140564 6uwt:H (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140565 6uwt:H (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140566 6uwt:I (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140567 6uwt:I (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140568 6uwt:J (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140569 6uwt:J (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140570 6uwt:K (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140571 6uwt:K (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140572 6uwt:L (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140573 6uwt:L (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140574 6uwt:M (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140575 6uwt:M (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140576 6uwt:N (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140577 6uwt:N (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    140578 6ux1:A (1.36) BS01 ZN 4.2.1.1
    4.2.1.69    		 GO:0002009 ... P00918 32244293
    140579 6ux2:B (3.01) BS01 ZN 2.1.1.56
    2.1.1.57
    2.7.7.48
    3.4.21.91
    3.6.1.15
    3.6.4.13    		 GO:0003968 ... Q32ZE1 32778820
    140580 6ux2:B (3.01) BS02 ZN 2.1.1.56
    2.1.1.57
    2.7.7.48
    3.4.21.91
    3.6.1.15
    3.6.4.13    		 GO:0003968 ... Q32ZE1 32778820
    140581 6ux4:A (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140582 6ux4:A (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140583 6ux4:A (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140584 6ux4:B (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140585 6ux4:B (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140586 6ux4:C (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140587 6ux4:C (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140588 6ux4:C (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140589 6ux4:D (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140590 6ux4:D (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140591 6ux4:D (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140592 6ux4:E (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140593 6ux4:E (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140594 6ux4:E (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140595 6ux4:F (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140596 6ux4:F (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140597 6ux4:F (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140598 6ux4:G (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140599 6ux4:G (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    140600 6ux4:G (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218